Жетісу өңірінің фаунасы өте бай әрі алуан түрлі. Бұл өңірде таулы, далалық, шөлейт және өзен-көл маңы табиғи аймақтары қатар кездеседі, соған сәйкес жануарлар дүниесі де сан қилы.
Таулы аймақтарда арқар, тауешкі, марал, қар барысы сияқты сирек жануарлар мекендейді. Өзен-көлдер маңында құстардан тырна, аққу, бірқазан, үйрек сияқты су құстары таралған.
Жетісу фаунасының кейбір өкілдері (қарақұйрық, құландар) Қазақстанның Қызыл кітабына енген, сондықтан оларды қорғау маңызды.