На территории Жонгар-Алатауского ГНПП вблизи кордонов расположены 13 фенологических площадок.
Государственные инспектора постоянно проводят контроль на фенологических площадках.
В ходе осеннего фенологического мониторинга на территории парка систематически фиксируются следующие важные фазы, свидетельствующие об окончании вегетационного периода растений (деревья и ветки).
Осенние фенологические наблюдения начинаются с началом осенней окраски, продолжаются до фазы полной осенней окраски и заканчиваются началом листопада, периодом массового листопада и окончанием листопада, знаменующим вступление деревьев в зимний покой.